Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nhsl1Q8CAF4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nhsl1Q8CAF4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Nhsl1Q8CAF4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nhsl1Q8CAF4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms