Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc90bQ8C3X2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc90bQ8C3X2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc90bQ8C3X2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms