Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa22Q8C1N8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms