Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NkrfQ8BY02 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NkrfQ8BY02 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms