Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Iffo1Q8BXL9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Iffo1Q8BXL9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Iffo1Q8BXL9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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