Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rbbp5Q8BX09 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms