Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dclk3Q8BWQ5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dclk3Q8BWQ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Dclk3Q8BWQ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms