Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smad3Q8BUN5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smad3Q8BUN5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smad3Q8BUN5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms