Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP07

Tmem220, Transmembrane protein 220, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem220Q8BP07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem220Q8BP07 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem220Q8BP07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem220Q8BP07 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms