Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga3Q8BMI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gga3Q8BMI3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga3Q8BMI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms