Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab3gap2Q8BMG7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab3gap2Q8BMG7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rab3gap2Q8BMG7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rab3gap2Q8BMG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rab3gap2Q8BMG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rab3gap2Q8BMG7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rab3gap2Q8BMG7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rab3gap2Q8BMG7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rab3gap2Q8BMG7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rab3gap2Q8BMG7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rab3gap2Q8BMG7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms