Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc2Q8BKV1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc2Q8BKV1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms