Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem87bQ8BKU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem87bQ8BKU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem87bQ8BKU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms