Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcfc2Q8BKT3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gcfc2Q8BKT3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms