Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy1Q8BIJ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rufy1Q8BIJ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.2 ms