Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc40Q8BI79 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc40Q8BI79 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc40Q8BI79 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.7 ms