Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdca8Q8BHX3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdca8Q8BHX3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms