Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco3Q8BH01 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms