Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samm50Q8BGH2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samm50Q8BGH2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samm50Q8BGH2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samm50Q8BGH2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samm50Q8BGH2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samm50Q8BGH2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samm50Q8BGH2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Samm50Q8BGH2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samm50Q8BGH2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samm50Q8BGH2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samm50Q8BGH2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms