Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms