Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX3

Kctd3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd3Q8BFX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kctd3Q8BFX3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kctd3Q8BFX3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kctd3Q8BFX3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms