Protein–RNA interactions for Protein: Q810A7

Ddx42, ATP-dependent RNA helicase DDX42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx42Q810A7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx42Q810A7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddx42Q810A7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx42Q810A7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx42Q810A7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddx42Q810A7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx42Q810A7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx42Q810A7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddx42Q810A7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Ddx42Q810A7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddx42Q810A7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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Ddx42Q810A7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx42Q810A7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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