Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc181Q80ZU5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc181Q80ZU5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc181Q80ZU5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms