Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm5bQ80Y84 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Kdm5bQ80Y84 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm5bQ80Y84 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm5bQ80Y84 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm5bQ80Y84 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms