Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Npm2Q80W85 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Npm2Q80W85 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Npm2Q80W85 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Npm2Q80W85 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms