Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
AknaQ80VW7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
AknaQ80VW7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
AknaQ80VW7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
AknaQ80VW7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
AknaQ80VW7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
AknaQ80VW7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
AknaQ80VW7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
AknaQ80VW7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
AknaQ80VW7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
AknaQ80VW7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.8■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AknaQ80VW7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.8■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
AknaQ80VW7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.76■■■■□ 3
AknaQ80VW7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
AknaQ80VW7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
AknaQ80VW7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms