Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sestd1Q80UK0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms