Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Rab3gap1Q80UJ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms