Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rims3Q80U57 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rims3Q80U57 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms