Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Avl9Q80U56 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Avl9Q80U56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Avl9Q80U56 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms