Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CyldQ80TQ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CyldQ80TQ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CyldQ80TQ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms