Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl29Q80T74 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhl29Q80T74 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl29Q80T74 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms