Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lca5Q80ST9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lca5Q80ST9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lca5Q80ST9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lca5Q80ST9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lca5Q80ST9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lca5Q80ST9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lca5Q80ST9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms