Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mcph1Q7TT79 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mcph1Q7TT79 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mcph1Q7TT79 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms