Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lamp3Q7TST5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms