Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ClmQ7TSN2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms