Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccp110Q7TSH4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms