Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnfsf18Q7TS55 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tnfsf18Q7TS55 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms