Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usmg5Q78IK2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usmg5Q78IK2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms