Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1cQ76I25 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Higd1cQ76I25 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1cQ76I25 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms