Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl35Q6ZWV7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms