Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup188Q6ZQH8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup188Q6ZQH8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms