Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Topbp1Q6ZQF0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Topbp1Q6ZQF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Topbp1Q6ZQF0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms