Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ino80Q6ZPV2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ino80Q6ZPV2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ino80Q6ZPV2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ino80Q6ZPV2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ino80Q6ZPV2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ino80Q6ZPV2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ino80Q6ZPV2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ino80Q6ZPV2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ino80Q6ZPV2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ino80Q6ZPV2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ino80Q6ZPV2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms