Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smpd4Q6ZPR5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smpd4Q6ZPR5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd4Q6ZPR5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms