Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cd200r4Q6XJV4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd200r4Q6XJV4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms