Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc44a1Q6X893 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc44a1Q6X893 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms