Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnip1Q6QD59 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnip1Q6QD59 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms