Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtifQ6PEE2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtifQ6PEE2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtifQ6PEE2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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