Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim37Q6PCX9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim37Q6PCX9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms